Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ercc4Q9QZD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc4Q9QZD4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms