Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh11Q9QYF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rdh11Q9QYF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh11Q9QYF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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