Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan3Q9QY33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan3Q9QY33 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan3Q9QY33 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms