Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp3Q9QY23 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp3Q9QY23 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkp3Q9QY23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms