Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP7

C1qtnf1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf1Q9QXP7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf1Q9QXP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf1Q9QXP7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qtnf1Q9QXP7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms