Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChmQ9QXG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChmQ9QXG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms