Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim44Q9QXA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim44Q9QXA7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim44Q9QXA7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms