Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc5Q9QX29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc5Q9QX29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc5Q9QX29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms