Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer2Q9QWW1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Homer2Q9QWW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms