Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdcQ9QW08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdcQ9QW08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms