Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma6Q9QUM9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma6Q9QUM9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms