Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabgef1Q9JM13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabgef1Q9JM13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabgef1Q9JM13 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms