Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr5Q9JLF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr5Q9JLF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr5Q9JLF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms