Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp4Q9JKV5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp4Q9JKV5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp4Q9JKV5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms