Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ldb3Q9JKS4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ldb3Q9JKS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms