Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trem3Q9JKE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem3Q9JKE1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms