Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ybx3Q9JKB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Ybx3Q9JKB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ybx3Q9JKB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms