Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pard6bQ9JK83 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pard6bQ9JK83 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms