Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga3Q9JJZ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182 ms