Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfra4Q9JJT2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra4Q9JJT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra4Q9JJT2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms