Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog8Q9JJA2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog8Q9JJA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms