Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc86Q9JJ89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc86Q9JJ89 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc86Q9JJ89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms