Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2aQ9JIS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2aQ9JIS5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2aQ9JIS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms