Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup50Q9JIH2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup50Q9JIH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup50Q9JIH2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms