Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2ird1Q9JI57 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird1Q9JI57 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird1Q9JI57 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms