Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zcchc17Q9ESX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc17Q9ESX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zcchc17Q9ESX4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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