Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Brd4Q9ESU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Brd4Q9ESU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Brd4Q9ESU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms