Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oxct2bQ9ESL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oxct2bQ9ESL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Oxct2bQ9ESL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms