Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3bQ9ES34 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3bQ9ES34 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms