Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn12Q9ER56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn12Q9ER56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn12Q9ER56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms