Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rapgef4Q9EQZ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rapgef4Q9EQZ6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rapgef4Q9EQZ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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