Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr9Q9EQU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr9Q9EQU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms