Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clca3a2Q9EQR4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a2Q9EQR4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a2Q9EQR4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms