Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a3bpQ9EQG9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a3bpQ9EQG9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms