Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn1Q9EPL2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn1Q9EPL2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms