Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft1Q9DCN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft1Q9DCN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms