Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms