Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde1Q9DBZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde1Q9DBZ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms