Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok3Q9DBU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms