Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc97Q9DBT3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc97Q9DBT3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms