Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtr1Q9DBC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmtr1Q9DBC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtr1Q9DBC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms