Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9DA42 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9DA42 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9DA42 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9DA42 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9DA42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9DA42 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9DA42 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9DA42 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9DA42 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9DA42 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9DA42 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9DA42 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms