Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actrt1Q9D9J3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms