Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q9D9H8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Q9D9H8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Q9D9H8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Q9D9H8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9D9H8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9D9H8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q9D9H8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9H8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q9D9H8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q9D9H8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q9D9H8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.4 ms