Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgap3Q9D8S3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap3Q9D8S3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap3Q9D8S3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms