Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc52a2Q9D8F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Slc52a2Q9D8F3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc52a2Q9D8F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms