Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifi35Q9D8C4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifi35Q9D8C4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi35Q9D8C4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms