Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4bQ9D8B3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4bQ9D8B3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms