Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm5Q9D806 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vstm5Q9D806 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms