Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn22Q9D7U6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn22Q9D7U6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn22Q9D7U6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms